Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Ccbe1Q3MI99 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Ccbe1Q3MI99 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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