Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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H2-M3Q31093 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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H2-M3Q31093 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
H2-M3Q31093 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
H2-M3Q31093 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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H2-M3Q31093 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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