Protein–RNA interactions for Protein: Q30D77

Col24a1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col24a1Q30D77 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Col24a1Q30D77 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms