Protein–RNA interactions for Protein: Q2TBE6

Pi4k2a, Phosphatidylinositol 4-kinase type 2-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pi4k2aQ2TBE6 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pi4k2aQ2TBE6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pi4k2aQ2TBE6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms