Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Cers3Q1A3B0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms