Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
ptchd1Q14B62 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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ptchd1Q14B62 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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