Protein–RNA interactions for Protein: Q149C3

Lingo4, Leucine-rich repeat and immunoglobulin-like domain containing-NOGO receptor-interacting protein 4, mousemouse

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Length 593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lingo4Q149C3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Lingo4Q149C3 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Lingo4Q149C3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lingo4Q149C3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lingo4Q149C3 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lingo4Q149C3 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lingo4Q149C3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lingo4Q149C3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lingo4Q149C3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lingo4Q149C3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Lingo4Q149C3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Lingo4Q149C3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
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Lingo4Q149C3 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms