Protein–RNA interactions for Protein: Q149B8

Perm1, PGC-1 and ERR-induced regulator in muscle protein 1, mousemouse

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Length 807 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Perm1Q149B8 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Perm1Q149B8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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Perm1Q149B8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Perm1Q149B8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Perm1Q149B8 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Perm1Q149B8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Perm1Q149B8 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Perm1Q149B8 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Perm1Q149B8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Perm1Q149B8 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms