Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VgfQ0VGU4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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VgfQ0VGU4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms