Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Cpne7Q0VE82 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms