Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Itgb8Q0VBD0 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Itgb8Q0VBD0 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Itgb8Q0VBD0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms