Protein–RNA interactions for Protein: Q0II04

Nebl, Nebulette, mousemouse

Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeblQ0II04 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
NeblQ0II04 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NeblQ0II04 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms