Protein–RNA interactions for Protein: Q09143

Slc7a1, High affinity cationic amino acid transporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 622 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc7a1Q09143 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Slc7a1Q09143 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms