Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Pate4Q09098 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms