Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

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Length 804 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Cass4Q08EC4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Cass4Q08EC4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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