Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Gdf3Q07104 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gdf3Q07104 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms