Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 2810403D21Rik-207ENSMUST00000152089 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Siah2Q06986 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms