Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Sh3bp2Q06649 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms