Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Thbs3Q05895 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms