Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Sox9Q04887 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Sox9Q04887 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms