Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Smpd1Q04519 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms