Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tff2Q03404 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms