Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Col6a2Q02788 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.2 ms