Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
NfiaQ02780 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NfiaQ02780 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms