Protein–RNA interactions for Protein: Q02739

Gjb5, Gap junction beta-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb5Q02739 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gjb5Q02739 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gjb5Q02739 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms