Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Gjb4Q02738 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gjb4Q02738 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms