Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Sec23aQ01405 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Sec23aQ01405 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms