Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Top2aQ01320 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Top2aQ01320 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms