Protein–RNA interactions for Protein: Q01149

Col1a2, Collagen alpha-2(I) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col1a2Q01149 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Col1a2Q01149 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms