Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Grin2cQ01098 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms