Protein–RNA interactions for Protein: Q00547

Hmmr, Hyaluronan mediated motility receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HmmrQ00547 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
HmmrQ00547 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
HmmrQ00547 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms