Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Psmb4P99026 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Psmb4P99026 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms