Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cds1P98191 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cds1P98191 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms