Protein–RNA interactions for Protein: P97762

rp9, Retinitis pigmentosa 9 protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
rp9P97762 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
rp9P97762 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
rp9P97762 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
rp9P97762 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
rp9P97762 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
rp9P97762 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms