Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pitx2P97474 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Pitx2P97474 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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