Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Bop1P97452 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Bop1P97452 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Bop1P97452 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms