Protein–RNA interactions for Protein: P85442

Vgll3, Transcription cofactor vestigial-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vgll3P85442 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Olfr533-206ENSMUST00000217179 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Vgll3P85442 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms