Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Polr1bP70700 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Polr1bP70700 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms