Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ctps1P70698 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms