Protein–RNA interactions for Protein: P70426

Rit1, GTP-binding protein Rit1, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rit1P70426 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rit1P70426 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms