Protein–RNA interactions for Protein: P70399

Tp53bp1, TP53-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53bp1P70399 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
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Tp53bp1P70399 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tp53bp1P70399 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tp53bp1P70399 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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Tp53bp1P70399 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tp53bp1P70399 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tp53bp1P70399 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tp53bp1P70399 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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Tp53bp1P70399 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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Tp53bp1P70399 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tp53bp1P70399 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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