Protein–RNA interactions for Protein: P70378

Fgf11, Fibroblast growth factor 11, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf11P70378 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Fgf11P70378 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms