Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Vamp7P70280 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 124.6 ms