Protein–RNA interactions for Protein: P70191

Traf5, TNF receptor-associated factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf5P70191 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf5P70191 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Traf5P70191 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Traf5P70191 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms