Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Vsnl1P62761 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Vsnl1P62761 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms