Protein–RNA interactions for Protein: P62069

Usp46, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 46, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp46P62069 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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Usp46P62069 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Usp46P62069 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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Usp46P62069 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm18558-201ENSMUST00000186253 1214 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Usp46P62069 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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Usp46P62069 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Zcwpw2-202ENSMUST00000187329 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Usp46P62069 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Usp46P62069 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp46P62069 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp46P62069 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp46P62069 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp46P62069 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp46P62069 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Usp46P62069 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Usp46P62069 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Gm25007-201ENSMUST00000083808 133 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Usp46P62069 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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