Protein–RNA interactions for Protein: P61924

Copz1, Coatomer subunit zeta-1, mousemouse

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz1P61924 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Copz1P61924 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms