Protein–RNA interactions for Protein: P61358

Rpl27, 60S ribosomal protein L27, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl27P61358 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl27P61358 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl27P61358 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Rpl27P61358 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Rpl27P61358 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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