Protein–RNA interactions for Protein: P61290

Psme3, Proteasome activator complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme3P61290 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Psme3P61290 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Psme3P61290 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms