Protein–RNA interactions for Protein: P60898

Polr2i, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2iP60898 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2iP60898 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2iP60898 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2iP60898 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2iP60898 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Polr2iP60898 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Polr2iP60898 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.2 ms